故事的背景设定在怪兽城市，城市里居住着许多非常害怕人类小孩的怪兽，这些怪兽相信小孩是有害且危险的。

因为这个城市的电力来源却是人类小孩惊吓的能量，这些伴随尖叫的惊吓能量被“怪兽公司”储存在瓶子中并转换成电力。

每到晚上怪兽公司的惊吓专员就通过不同的传送门，进入人类世界惊吓小孩，他们也因为勇敢进入小孩的房间而成为怪兽城市的英雄。

怪兽公司的模范员工就是詹姆士·P·苏利文，一只毛茸茸的蓝色大怪兽（绰号毛怪），他的工作同伴是一只叫做麦克·华斯基的独眼绿色怪兽（绰号大眼仔），而一只像变色龙的怪兽“蓝道”则是苏利文的最大敌手。

有一天，当苏利文正在整理文件的时候，发现一扇违反公司规定、被遗留在“惊吓楼层”的门。

苏利文正在检查这扇门的时候，一个叫做“阿布（Boo）”的人类小女孩突然经由这扇门，进入了怪兽世界。

苏利文（毛怪）和麦克（大眼仔）最终发现，这一切都是蓝道及公司高层为了解决怪兽城市电力问题所进行的邪恶阴谋。

因为危及公司秘密进行的阴谋，麦克和苏利文被流放人类世界的屋脊—喜马拉雅山区，最后用尽一切办法终于把阿布送回人类世界，并且拆穿蓝道的阴谋。

在这过程他们发现儿童欢乐的笑声比惊吓蕴含更多的能量，此后每晚怪兽公司不再派惊吓专员去吓小朋友，而是由大眼仔等可爱怪兽去逗弄小朋友以汲取欢乐的能源。