东芬兰大学最近的一项研究表明，遗传变异决定了染色质的可及性和转录因子的结合。染色质由 DNA 和附着在其上的蛋白质组成。这种包装的密度受转录因子调节，基因表达需要 DNA 可及性。该研究发表在《核酸研究》杂志上。

大多数增加复杂疾病风险的遗传变异都针对基因蛋白质编码区域之外的区域。转录因子需要与染色质内的特定 DNA 序列结合，改变该序列可以阻止结合，从而影响基因表达。染色质可及性通常用于识别调节因子的结合位点。

该研究比较了两种基因不同的小鼠品系的肝脏中基因调节区和基因表达的活性，以及​​对高脂肪饮食的反应。这些小鼠品系通常用于研究肥胖易感性和 2 型糖尿病。

当将染色质可及性与常规和高脂肪饮食进行比较时，在小鼠品系中没有观察到差异。然而，小鼠品系之间的染色质可及性存在显着差异，特别是在品系之间存在遗传差异的染色体位置。此外，这些差异通常发生在菌株之间表达不同的基因附近。因此，遗传变异影响转录因子的结合，这些变化反映在基因表达中。

该研究还研究了如何可靠地预测单个转录因子结合位点的遗传变异引起的变化，以及这需要什么类型的基因组信息。

描述染色质可及性、遗传变异和转录因子结合区域的数据组合提供了直接影响染色质可及性的转录因子结合的最佳预测。然而，在相同的遗传变异影响多个转录因子的结合序列的情况下，预测的可靠性会受到影响。因此，必须直接测量遗传变异对每个转录因子结合的影响。

“这项研究加深了我们对遗传学、染色质修饰和指导基因表达的转录因子作用之间联系的理解。此外，该研究还描述了如何利用公共数据集来研究复杂疾病遗传性危险因素背后的机制。”东芬兰大学的大学教师 Juho Mononen 说道。