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导读 今天在《自然遗传学》杂志上发表的国际基因组学研究成果,让我们能够培育出更能抵御干旱、盐碱和虫害的全新作物品种。这项名为利用端粒到端
今天在《自然遗传学》杂志上发表的国际基因组学研究成果,让我们能够培育出更能抵御干旱、盐碱和虫害的全新作物品种。
这项名为“利用端粒到端粒基因组组装解锁植物遗传学”的研究由默多克大学作物和食品创新中心(CCFI)的研究人员领导。
完整的端粒到端粒 (T2T) 组装使科学家能够绘制整个基因组图谱,为分子育种奠定基础,以改善植物在压力条件下的表现。
研究负责人兼 CCFI 主任 Rajeev Varshney 教授表示,基因组组装的结果代表了遗传学的未来。
“基因组组装本质上就像是一块一块地拼拼图。T2T 基因组组装提供了整个基因组的完整、端到端的图像,”Varshney 教授说。
“我们的工作是确保基因组中的数千个基因沿着整个染色体以正确的顺序组装,并且每个部分完美地组合在一起。”
第一作者兼 CCFI 研究员 Vanika Garg 博士表示,基因测序目前所能达到的精确度水平导致了这一突破。
“到目前为止,T2T 基因组组装还无法实现,不完整的基因测序可能会导致错误,例如错误注释,”Garg 博士说。
“这意味着某些理想性状的基因被遗漏了。但由于测序技术的进步,我们终于可以为任何作物物种进行 T2T 基因组组装。”
Varshney 教授和他的研究团队目前正在与来自澳大利亚、英国、德国、美国和中国的多个实验室合作,开发小麦、鹰嘴豆、蚕豆、木瓜、西番莲、番荔枝、香蕉和菠萝等几种作物的 T2T 基因组组装或近乎完整的基因组组装。
“我们正与国内外合作者一起,在几种作物中应用 T2T 基因组组装方法,我们非常高兴看到这能够推动澳大利亚和国外的农业研究,”瓦什尼教授说。
“T2T 基因组组装可以进入难以测序的区域,这开辟了无数突破性的研究可能性,例如创造出满足我们未来需求的全新作物品种。”