研究团队对油茶和小果油茶的叶绿体基因组进行了全序列分析，发现了显著差异，阐明了它们的系统发育关系。该研究开发了17个用于区分油茶和小果油茶的叶绿体DNA引物，为评估油茶的遗传多样性提供了宝贵的工具。

这些结果对于未来油茶种质资源评估、分子系统发育分析以及油茶在农业和工业实践中的创新和利用的研究和实际应用具有重要的潜力。

油茶因其高含油量和保健功效而闻名，是一种重要的木本油料作物，尤其是在中国，具有重要的栽培价值。尽管油茶具有重要意义，但由于其复杂的核基因组和种间杂交，油茶属植物之间的系统发育关系，尤其是小果油茶和油茶之间的系统发育关系仍然存在争议。

此外，目前还未见有关油茶叶绿体基因组的报道，也未对油茶与油茶进行过比较分析，这些问题的解决阻碍了油茶的有效育种和生产。

2024 年 7 月 24 日发表在《热带植物》上的一项新研究旨在通过分析 C. oleifera 和 C. meiocarpa 的叶绿体基因组并开发用于品种鉴定和资源利用的分子标记来阐明这些关系。

该研究采用比较基因组学技术分析了C. meiocarpa(CKX/XG)和C. oleifera(HZP)的叶绿体基因组，重点研究了基因组结构、重复序列、IR区域变异、核苷酸多样性和系统发育关系。

叶绿体基因组呈现典型的环状四聚体结构，不同物种间大小差异不大。重复序列和简单重复序列(SSR)分布不均，不同物种间模式不同。IR 区域的扩张和收缩揭示了基因组的适应性，特别是在 HZP 和 CKX/XG 之间。

核苷酸多样性分析发现ycf1基因突变最多，且基因间区域变异明显;系统发育分析证实CKX和XG与HZP亲缘关系不近。

此外，根据多态性位点设计了56对引物，其中17对引物成功验证了多态性位点的评估，为油茶属植物的鉴定和遗传研究提供了重要工具。

该研究高级研究员郑道表示：“本研究为今后油茶研究提供了高质量的叶绿体基因组和可靠的分子标记资源。”

本研究主要对油茶和小果油茶的叶绿体基因组进行了研究，发现油茶存在显著的遗传差异，支持油茶作为一个独立的物种。17个引物的开发有助于物种鉴定和资源评估，有利于育种和生产实践。这些发现为今后油茶研究提供了高质量的叶绿体基因组和可靠的分子标记资源。